Film animasi aksi-komedi ini menghadirkan dunia unik yang terinspirasi Jepang feodal, di mana para kucing hidup sebagai penguasa. Konflik bermula dari ambisi licik Ika Chu, pejabat tinggi Shogun, yang ingin memperluas istananya dengan mengorbankan desa miskin Kakamucho.

Untuk mengusir warga tanpa terlihat bersalah, Ika Chu merancang rencana licik dengan menunjuk Hank, seekor anjing tahanan, sebagai samurai pelindung desa. Harapannya, warga akan menolak Hank dan pergi dengan sendirinya. Namun di luar dugaan, Hank justru berusaha membuktikan dirinya.

Dengan bantuan Jimbo, mantan samurai yang eksentrik, Hank mulai berlatih dan perlahan mendapatkan kepercayaan warga. Ia bahkan berhasil menghadapi berbagai ancaman, termasuk anak buah Ika Chu yang mencoba menghancurkan desa lebih cepat.

Sayangnya, popularitas membuat Hank sempat besar kepala dan lalai, hingga desa Kakamucho akhirnya diserang dan hancur. Merasa bersalah, Hank hampir menyerah, namun ia kembali bangkit setelah teringat sumpahnya sebagai samurai.

Bersama Jimbo dan warga desa, Hank menyusun rencana cerdik dengan membuat replika kota dari kertas sebagai jebakan. Saat pasukan Ika Chu menyerang, mereka justru terperangkap dan dikalahkan. Kekacauan ini membuat Shogun mengetahui rencana jahat Ika Chu, yang akhirnya melarikan diri.

Pertarungan klimaks terjadi saat Hank menghadapi Ika Chu di istananya. Ia berhasil menggagalkan ancaman banjir besar yang bisa menghancurkan desa, sekaligus menyelamatkan seluruh warga Kakamucho.

Di akhir cerita, Hank dianggap layak menjadi samurai, namun ia memilih menyerahkan posisi tersebut kepada Emiko, anak kucing yang penuh semangat. Hank dan Jimbo pun melanjutkan perjalanan mereka sebagai guru dan murid, dengan hubungan yang kini semakin erat.