Dilansir dari Paramount Pictures beginilah plotnya film ini, "Setelah menetap di Green Hills, Sonic sangat ingin membuktikan bahwa dia memiliki apa yang diperlukan untuk menjadi pahlawan sejati, ujiannya datang ketika Dr Robotnik kembali, kali ini dengan mitra baru, Knuckles, untuk mencari batu emerald yang memiliki kekuatan untuk menghancurkan peradaban. Sonic bekerja sama dengan sahabat karibnya sendiri, Tails, dan bersama-sama mereka memulai penjelajahan dunia. perjalanan untuk menemukan emerald sebelum jatuh ke tangan yang salah."