Film Raid 2 kembali mengikuti sosok Amay Patnaik, petugas Indian Revenue Service yang dikenal jujur dan berani. Sepanjang kariernya, ia telah menyita sekitar Rp705 triliun dari berbagai operasi penggerebekan. Kali ini, Amay dipindahkan untuk ke-74 kalinya ke kota fiktif Bhoj di Madhya Pradesh, di mana ia membidik target besar berikutnya, seorang politisi korup bernama Manohar Dhankar alias Dada Manohar Bhai, dalam operasi ke-75-nya.

Saat melakukan penggerebekan untuk menemukan uang hitam milik Dada Manohar Bhai, Amay justru mengalami hambatan hingga berujung pada penangguhan jabatannya. Namun setelah statusnya dipulihkan, ia kembali melanjutkan penyelidikan dengan bantuan tim pajak serta pengacara Devinder Gehlot. Gehlot kemudian mengajukan gugatan kepentingan publik (PIL) guna membongkar praktik keuangan ilegal yang dilakukan oleh Dada Manohar Bhai.

Langkah ini membuat Dada Manohar Bhai mencoba menyuap Gehlot sekitar Rp84 miliar. Namun tanpa ia sadari, Gehlot bertindak atas arahan Amay. Uang suap tersebut justru dijadikan bukti di pengadilan, yang akhirnya memerintahkan penyelidikan resmi terhadap jaringan bisnis gelap sang politisi.

Seiring penyelidikan berlangsung, Amay mengungkap sisi gelap Dada Manohar Bhai yang selama ini bersembunyi di balik citra dermawan. Ia ternyata memanfaatkan perempuan rentan dengan iming-iming pekerjaan pemerintah, bahkan menggunakan nama mereka untuk membeli aset ilegal sebagai bagian dari praktik pencucian uang. Selain itu, ia juga mendirikan perusahaan cangkang atas nama warga miskin tanpa sepengetahuan mereka, untuk mengalirkan dana ke rekening luar negeri.

Dengan bukti yang semakin kuat, Amay mempersiapkan timnya untuk melakukan penggerebekan besar-besaran terhadap seluruh aset Dada Manohar Bhai. Di sinilah terungkap bahwa penangguhan Amay sebelumnya hanyalah strategi untuk mengecoh targetnya.

Puncaknya terjadi saat penggerebekan di sebuah hotel mewah bintang lima milik Dada Manohar Bhai, di mana ditemukan uang tunai dalam jumlah besar, dokumen properti ilegal, hingga perlengkapan berlapis emas yang disamarkan sebagai logam biasa. Bahkan, sebuah patung tangan emas murni juga ditemukan tersembunyi di kolam depan kantor sang politisi.

Ketika semua kebusukan mulai terungkap, Dada Manohar Bhai yang terpojok mencoba menyerang Amay. Namun aksinya dihentikan oleh ibunya sendiri, yang telah mengetahui seluruh kebenaran berkat Malini, istri Amay. Menyadari kesalahannya, Dada Manohar Bhai akhirnya menyerahkan diri.

Di akhir cerita, sosok baru bernama Rameshwar Singh alias 'Tauji' muncul dan menawarkan kerja sama dengan Dada Manohar Bhai, membuka jalan bagi konflik yang lebih besar di sekuel berikutnya.