Cerita dimulai tahun 1818, saat Abraham Lincoln kecil tinggal di Indiana bersama orang tuanya, Nancy dan Thomas. Mereka bekerja di perkebunan milik Jack Barts. Di sana, Lincoln berteman dengan William Johnson, anak Afrika-Amerika, dan berani membela William ketika ia dipukuli seorang pedagang budak.

Aksi itu berujung petaka, keluarga Lincoln dipecat. Malam harinya, Lincoln menyaksikan Barts menerobos rumah mereka dan menyerang ibunya. Nancy jatuh sakit parah dan meninggal keesokan harinya.

Sembilan tahun kemudian, Lincoln yang diliputi dendam mencoba membunuh Barts di dermaga. Namun ia syok saat mengetahui Barts bukan manusia biasa, melainkan vampir.

Sebelum Lincoln tewas, ia diselamatkan oleh Henry Sturges, pria misterius yang pernah ia temui di bar. Sturges menawarkan untuk melatih Lincoln menjadi pemburu vampir, dan Lincoln menerimanya. Setelah latihan keras selama satu dekade, mereka pindah ke Springfield, Illinois.

Di sana, Sturges mengungkap rahasia besar, vampir di Amerika adalah keturunan Adam, vampir kuat yang memiliki perkebunan di New Orleans bersama saudari perempuannya, Vadoma.

Sturges juga menjelaskan kelemahan vampir, perak, dan memberinya jam saku perak sebagai senjata. Lincoln pun mulai memburu vampir berdasarkan daftar nama yang dikirim Sturges lewat surat.

Di Springfield, Lincoln berteman dengan Joshua Speed, pemilik toko, dan bertemu Mary Todd. Meski sudah diperingatkan agar tidak menjalin hubungan dekat demi keselamatan orang terkasih, Lincoln justru jatuh cinta pada Mary.

Dalam salah satu misinya, Lincoln akhirnya berhasil membunuh Barts. Namun sebelum itu, ia menemukan fakta mengejutkan, Henry Sturges ternyata juga seorang vampir.

Lincoln menuntut penjelasan. Sturges mengaku bahwa Adam telah mengubahnya menjadi vampir dan membunuh istrinya. Alasannya kejam, jiwa Sturges dianggap 'tidak murni', sementara istrinya tidak.

Karena vampir tidak bisa saling membunuh, Sturges membutuhkan manusia seperti Lincoln untuk membalas dendamnya pada Adam. Dari sinilah misi Lincoln berubah, bukan sekadar balas dendam pribadi, tapi perang rahasia melawan vampir yang menguasai Amerika dari balik bayangan.