Berlatar di Universal Century 0096, tiga tahun setelah peristiwa Second Neo Zeon War, sebuah unit tentara bayaran independen bernama Argent Keil mendapat kontrak dari Earth Federation untuk membunuh seorang pejabat tinggi bernama Azami Meggineh. Ia dicurigai bekerja sama dengan sisa- sisa pasukan Zeon.

Namun, saat misi dimulai, armada Argent Keil tiba-tiba diserang oleh skuadron mobile suit Jegan milik Federation sendiri. Serangan mendadak ini membuat situasi berubah kacau. Dalam kondisi genting, pilot Shavetail diperintahkan oleh pemimpin unit, Mabel Lena, untuk meluncur menggunakan mobile suit eksperimental Delta Zayin. Ia ditemani rekan pilotnya, Babia, guna menghadapi serangan tersebut.

Setelah pertempuran singkat, Mabel memutuskan membawa armada menjauh demi keselamatan, sementara Shavetail diminta melanjutkan misi sendirian. Dalam perjalanan, Shavetail dan Babia mengenang rekan mereka, Fixzi Fix, seorang pilot Newtype yang gugur dalam pertempuran sebelumnya dan meninggalkan luka mendalam bagi keduanya.

Tak hanya itu, Shavetail mulai mengalami penglihatan aneh yang berkaitan dengan fenomena Axis Shock. Ia kemudian mengetahui bahwa perisai Delta Zayin ternyata menggunakan teknologi psycho-frame yang awalnya dirancang untuk Fixzi.

Saat tiba di reruntuhan A Baoa Qu, Shavetail akhirnya berhadapan langsung dengan Azami dan pasukannya, termasuk bawahannya, Joff Idiy. Dalam pengungkapan mengejutkan, Azami mengaku bahwa ia sendiri yang merancang kontrak pembunuhan tersebut sebagai jebakan untuk menjatuhkan Argent Keil.

Pertempuran sengit pun tak terhindarkan. Dalam momen krusial, psycho-frame pada Delta Zayin aktif dan beresonansi dengan kemampuan Newtype yang mulai bangkit dalam diri Shavetail. Kekuatan tersebut akhirnya memungkinkan mereka untuk mengalahkan Joff dan Azami, sekaligus mengakhiri konspirasi yang berbahaya.