Not Friends mengawali ceritanya dengan sosok Pae yang diperankan Anthony Buisseret, seorang siswa pindahan yang dikenal dingin dan sinis. Ia baru saja masuk ke sekolah barunya di tengah semester keenam, sebuah posisi canggung yang membuatnya sulit beradaptasi. Di sekolah ini, Pae bertemu Joe yang diperankan Pisitpol Ekaphongpisit, murid populer yang ramah dan disukai hampir semua orang. Selain mereka, ada Bokeh yang diperankan Thitiya Jirapornsilp serta Ping yang dimainkan Tanakorn Tiyanont, dua siswa yang kelak ikut terlibat dalam dinamika emosional yang terbentuk setelah sebuah tragedi besar mengguncang sekolah.

Sejak awal, hubungan Pae dan Joe sudah terasa janggal. Joe dengan tulus ingin berteman dan berusaha mendekati Pae, namun semua ajakan itu justru ditolak mentah-mentah. Pae memilih menjaga jarak dan bersikap dingin, seolah tidak ingin terikat dengan siapa pun di lingkungan barunya. Penolakan ini menjadi ironi pahit ketika keesokan harinya Joe meninggal dunia akibat kecelakaan mobil. Kabar duka tersebut langsung menyelimuti sekolah dengan suasana kehilangan yang mendalam, mengingat Joe adalah sosok yang sangat dicintai.

Di tengah duka kolektif itu, Pae justru melihat sebuah peluang. Meski tidak memiliki hubungan dekat dengan Joe, ia menyadari bahwa tragedi ini bisa menjadi jalan pintas untuk mempercantik aplikasi masuk perguruan tinggi. Dengan penuh perhitungan, Pae mengajukan ide kepada pihak sekolah untuk membuat sebuah film pendek sebagai bentuk penghormatan atas kematian Joe. Usulan tersebut diterima dengan antusias, karena dianggap sebagai cara kreatif untuk mengenang siswa favorit yang telah pergi.

Proses pembuatan film inilah yang menjadi inti konflik emosional Not Friends. Pae mulai menggali cerita tentang Joe dari orang-orang di sekitarnya, termasuk Bokeh dan Ping, yang masing-masing menyimpan kenangan dan sudut pandang berbeda tentang sosok Joe. Tanpa disadari, Pae perlahan terlibat lebih dalam dari yang ia rencanakan. Film yang awalnya dibuat demi kepentingan pribadi justru membuka ruang refleksi tentang empati, kejujuran, dan makna kehilangan.

Semakin jauh proses berjalan, batas antara niat tulus dan kepentingan pribadi Pae semakin kabur. Ia dihadapkan pada pertanyaan moral tentang apakah pantas memanfaatkan duka orang lain untuk ambisi diri sendiri. Di sisi lain, cerita tentang Joe yang ia rangkai dari berbagai kesaksian mulai membentuk gambaran manusiawi tentang seorang teman yang sebenarnya tak pernah sempat ia kenal.