Pet Sematary: Bloodlines membawa kita kembali ke Ludlow, Maine, pada tahun 1969, dengan fokus pada Jud Crandall yang diperankan Jackson White, Bill Baterman yang dimainkan David Duchovny, Timmy Baterman yang diperankan Jack Mulhern, Norma yang dimainkan Natalie Alyn Lind, serta Manny Rivers yang diperankan Forrest Goodluck. Film ini menjadi prekuel yang menggali asal-usul teror legendaris dari pemakaman terlarang yang selama ini hanya jadi bisikan gelap di kota kecil tersebut.

Kisah dimulai dengan tragedi keluarga Baterman. Bill Baterman, seorang petani, menyeret jasad putranya Timmy yang baru pulang dari Perang Vietnam dan meninggal karena bunuh diri ke area pet cemetery. Keputusan putus asa itu langsung memicu kengerian. Tak lama setelah penguburan, anjing keluarga, Hendrix, merasakan kejanggalan dan menggali tanah, hingga sebuah tangan tiba- tiba muncul dari dalam makam. Sejak momen itu, Ludlow tidak lagi sama.

Jud Crandall sendiri hidup bersama kedua orang tuanya dan tengah merencanakan masa depan di luar Ludlow. Ia berniat meninggalkan kota untuk bergabung dengan Peace Corps di Michigan bersama kekasihnya, Norma. Dalam perjalanan ke kota, Jud bertemu Bill dan melihat foto lama yang menunjukkan dirinya, Timmy, dan Manny Rivers saat masih kecil. Bill bersikeras bahwa Timmy telah pulang dengan hormat dari perang, seolah menyembunyikan kebenaran yang jauh lebih kelam.

Keanehan makin terasa ketika Jud dan Norma menemukan Hendrix dalam kondisi kotor dan agresif. Saat mengantar anjing itu kembali ke rumah Baterman, mereka bertemu Timmy yang kini bertingkah aneh dan mengerikan. Insiden demi insiden pun terjadi. Norma terluka, Manny mengalami kecelakaan misterius di ladang, dan Timmy mulai menunjukkan sisi gelapnya dengan bisikan tentang membunuh sebelum dibunuh. Teror ini menyebar, menyeret warga Ludlow satu per satu ke dalam lingkaran ketakutan.

Puncaknya, serangkaian serangan brutal membuat Jud dan Manny mencari jawaban ke seorang pastor. Dari sanalah terungkap sejarah kelam Ludlow. Tanah pet cemetery dulunya milik suku Mi'kmaq dan memiliki kekuatan terkutuk. Seorang pemukim bernama Ludlow pernah bangkit kembali setelah dikubur di sana dan harus dibunuh ulang karena menjadi kanibal. Rahasia ini selama ratusan tahun dijaga oleh para leluhur warga demi mencegah orang luar mengetahui kebenaran.