The Book of Clarence menghadirkan LaKeith Stanfield sebagai Clarence, Omar Sy sebagai Barabbas the Immortal, RJ Cyler sebagai Elijah, Anna Diop sebagai Varinia, serta Alfre Woodard sebagai Mary. Film ini mengajak kita menengok Yerusalem tahun 33 Masehi lewat sudut pandang yang segar, satir, dan penuh keberanian, dibagi dalam tiga bagian bertajuk "The 13th Apostle", "The New Messiah", dan "The Crucifixion".

The Book of Clarence dibuka dengan kehidupan Clarence, seorang pria Ibrani yang hidup pas pas an di Yerusalem dan terus dikejar utang. Bersama sahabatnya Elijah, ia kalah dalam balapan kereta melawan Mary Magdalene, sekaligus kehilangan uang yang sangat dibutuhkan. Nasibnya makin rumit karena Clarence berutang pada rentenir kejam Jedediah the Terrible, sementara diam diam ia menaruh hati pada Varinia, adik Jedediah. Di tengah tekanan itu, Clarence juga kerap menjadi sasaran kecurigaan tentara Romawi atas kejahatan yang tidak ia lakukan.

Suatu hari, setelah pengalaman halusinatif akibat opium, Clarence melihat cahaya di atas kepalanya dan mendapat ide nekat. Ia memutuskan berpura pura menjadi mesias, menunggangi popularitas Yesus demi melunasi utang dan meraih kejayaan. Usahanya langsung mentok ketika Yohanes Pembaptis menamparnya karena dianggap munafik. Clarence bahkan menawarkan diri menjadi rasul ke 13 kepada para murid Yesus, namun hanya ditertawakan. Saudara kembarnya, Thomas, yang merupakan salah satu dari Dua Belas Rasul, juga memandang Clarence dengan sinis, memicu konflik keluarga yang emosional.

Ambisi Clarence berlanjut ketika Judas Iskariot menantangnya membebaskan budak gladiator sebagai syarat membuktikan diri. Dengan kecerdikan, Clarence berhasil mengalahkan Barabbas dalam duel yang tampak mustahil, membebaskannya dan menjadikannya sekutu. Bersama Elijah, Barabbas, dan Zeke, Clarence berkeliling melakukan mukjizat palsu, menghidupkan kembali Elijah dan mengkhotbahkan "knowledge over belief". Uang mengalir deras, namun Clarence memilih menggunakannya untuk membebaskan para gladiator, bukan membayar utangnya.

Kisah ini berbelok ketika Mary Magdalene hampir dirajam dan Yesus datang menghentikan kekerasan dengan mukjizat nyata. Elijah mulai percaya, sementara Clarence tetap terombang ambing. Pengkhianatan Varinia membuat Clarence ditangkap Romawi sebagai mesias palsu. Di hadapan Pontius Pilatus, ia mengaku penipu, namun secara mengejutkan mampu berjalan di atas air. Meski demikian, takdir penyaliban tetap menantinya. Di saat terakhir, Clarence menolak mengkhianati Yesus. Kebangkitan Clarence oleh Yesus di akhir cerita menutup perjalanan spiritualnya, dari skeptis menjadi seseorang yang akhirnya tahu dan percaya.