Film thriller aksi 96 Minutes menghadirkan ketegangan tinggi tentang pilihan hidup-mati dalam waktu yang sangat terbatas.

Cerita berpusat pada Sung Kang-jen, mantan petugas penjinak bom yang memilih meninggalkan pekerjaannya setelah insiden tragis tiga tahun sebelumnya. Saat itu, ia harus memilih menjinakkan bom di bioskop demi menyelamatkan istrinya, Huang Hsin, dan atasannya. Keputusan itu berujung fatal, ratusan orang tewas dalam ledakan di pusat perbelanjaan yang tak sempat ia tangani. Rasa bersalah pun terus menghantuinya.

Tiga tahun kemudian, tepat di hari peringatan tragedi tersebut, Sung dan istrinya yang kini bekerja sebagai penyidik kriminal menaiki kereta cepat Taiwan dari Taipei menuju Kaohsiung. Namun perjalanan yang seharusnya aman berubah menjadi mimpi buruk ketika mereka menemukan bom telah dipasang di dalam kereta.

Teror makin kompleks saat diketahui bahwa bom tersebut terhubung dengan kereta lain yang melaju paralel. Sistemnya dirancang rumit, waktu hitung mundur berbanding terbalik dengan kecepatan kereta, dan jika bom di satu kereta dijinakkan, maka bom di kereta lainnya akan langsung meledak.

Pelaku di balik aksi ini ternyata memiliki kaitan dengan tragedi masa lalu Sung, sengaja memaksanya kembali pada dilema yang sama, mengorbankan sebagian nyawa demi menyelamatkan yang lain. Dalam waktu hanya 96 menit, Sung harus menghadapi masa lalunya sekaligus membuat keputusan yang akan menentukan hidup ratusan orang.