Aadhavan dibintangi Suriya sebagai Madhavan Subramaniam yang dikenal dengan nama Aadhavan. Film ini membuka cerita dengan sebuah kontrak pembunuhan terhadap seorang godman palsu yang dianggap berbahaya. Tugas itu jatuh ke tangan Aadhavan, tentara bayaran andalan yang dibesarkan oleh Ibrahim Rowther. Setelah sukses menuntaskan misi tersebut, namanya makin dikenal di dunia hitam dan ia menerima berbagai kontrak dari berbagai negara.

Konflik utama dimulai saat Aadhavan diminta membunuh hakim ternama Subramaniam oleh Dr. Abdul Kulkarni, sosok yang terancam oleh putusan hukum terkait kasus penculikan anak dan perdagangan organ. Upaya pertama Aadhavan gagal dan ia merasa harga dirinya direndahkan. Ia pun menyusun rencana nekat dengan menyamar sebagai Murugan dan masuk ke rumah Subramaniam melalui bantuan seorang pelayan bernama Bannerjee.

Perlahan, Aadhavan justru berhasil mencuri hati keluarga sang hakim, termasuk ibunya dan cucunya, Thara. Thara terpikat pada kepribadian Aadhavan yang terlihat sederhana dan cerdas. Namun di balik penyamaran itu, Aadhavan tetap menjalankan misinya. Sebuah rencana peledakan disusun saat keluarga pergi ke Darjeeling, tetapi ledakan terjadi di waktu yang tidak tepat.

Kecurigaan Thara memuncak hingga akhirnya Aadhavan mengaku bahwa ia adalah Madhavan, putra lama Subramaniam yang hilang. Pengakuan itu ternyata bukan sekadar kebohongan. Lewat kilas balik, kita mengetahui bahwa masa kecil Madhavan dipenuhi tragedi. Sebuah bom yang tersembunyi dalam hadiah ulang tahun menewaskan orang tua Thara. Subramaniam menyalahkan Madhavan dan mengusirnya. Dalam pelarian, Madhavan terjerumus ke dunia kriminal sebelum akhirnya diselamatkan dan dibesarkan oleh Ibrahim Rowther dengan identitas baru sebagai Aadhavan.

Di masa kini, terungkap bahwa Aadhavan sebenarnya tidak pernah berniat membunuh ayahnya. Ia sengaja melesetkan tembakan saat menyadari targetnya adalah darah dagingnya sendiri. Polisi yang mengetahui kebenaran itu memanfaatkannya sebagai agen rahasia untuk membongkar jaringan kriminal besar. Fakta ini akhirnya diungkap kepada Subramaniam yang terharu dan bersatu kembali dengan putranya.

Pertarungan klimaks terjadi saat Kulkarni menyerang. Aadhavan melindungi ayah dan Thara, sekaligus menuntaskan musuh besarnya. Para dalang di balik konspirasi berhasil ditangkap. Meski harus menjalani hukuman singkat atas kesalahan masa lalu, Madhavan akhirnya bebas dan kembali ke rumah sebagai pahlawan. Ia dan Thara menikah, membuka lembaran baru dengan keluarga besar yang kini menerima dirinya sepenuhnya.