Bayi Ajaib mengisahkan perjalanan kelam Kosim Nugraha yang diperankan Vino G. Bastian, Laras yang dimainkan Sara Fajira, serta Dorman yang dibawakan Adipati Dolken, dengan anak mereka Didi dan sosok arwah Albert Dominique sebagai pusat teror cerita. Film horor ini dibuka dengan kehidupan Kosim Nugraha, seorang pria desa biasa yang mendadak berubah nasib setelah menemukan permata di sungai Desa Hirupbagja. Penemuan tersebut membuat Kosim kaya raya dalam waktu singkat, mengantarkannya menjadi juragan tanah yang disegani warga. Kehidupan barunya terasa semakin sempurna ketika ia menikahi Laras dan menikmati kemakmuran yang tak pernah ia bayangkan sebelumnya.

Namun kebahagiaan itu perlahan berubah menjadi mimpi buruk. Saat anak mereka, Didi, lahir ke dunia, muncul kejanggalan yang awalnya tak disadari. Tanpa diketahui Kosim dan Laras, jiwa Didi telah dirasuki arwah Albert Dominique, sosok kejam yang haus darah dan membawa dendam lama. Sejak saat itu, teror demi teror mulai menghantui Desa Hirupbagja, menebar ketakutan di tengah kehidupan warga yang sebelumnya tenang.

Kosim memilih menutup-nutupi kebenaran tersebut karena ambisinya yang tengah memuncak. Ia mencalonkan diri sebagai kepala desa dan berusaha keras menjaga citra di mata masyarakat. Situasi semakin sulit karena Kosim harus berhadapan dengan Soleh, rival politik yang telah lebih dulu mendapatkan simpati warga. Terbukanya fakta bahwa anaknya menjadi sumber teror gaib bisa menghancurkan peluang Kosim sekaligus menjatuhkan kehormatan keluarganya.

Ketegangan memuncak ketika arwah Albert Dominique tak lagi hanya meneror warga desa, tetapi mulai mengancam keselamatan Laras dan Kosim sendiri. Ancaman itu memaksa Kosim menghadapi kenyataan pahit dan membuatnya berada di persimpangan sulit antara ambisi kekuasaan atau keselamatan keluarganya. Pada titik ini, Kosim memutuskan untuk membebaskan Didi dari pengaruh arwah jahat tersebut, apa pun risikonya.

Upaya tersebut membawa Kosim berhadapan dengan Dorman, seorang dukun hitam yang menyimpan dendam turun-temurun. Dorman ingin membalaskan penderitaan kakek buyutnya yang kehidupannya dihancurkan oleh orang-orang desa di masa lalu. Melalui kekuatan gelap, Dorman memanfaatkan arwah Albert Dominique sebagai alat balas dendam. Konflik antara niat Kosim menyelamatkan anaknya dan ambisi gelap Dorman menjadi puncak cerita yang penuh ketegangan, mempertemukan dosa masa lalu, keserakahan, dan harga mahal yang harus dibayar.