Bon Appetit, Your Majesty menceritakan kisah Yeon Ji-yeong, seorang koki modern yang secara tak terduga terlempar ke masa Dinasti Joseon saat terjadi gerhana matahari. Ia tiba di istana kerajaan milik Raja Yi Heon, seorang raja muda yang hidupnya dibayangi trauma akibat kematian ibunya dan terobsesi dengan balas dendam terhadap para pejabat korup.

Awalnya dianggap sebagai orang asing yang mencurigakan, Ji-yeong akhirnya diangkat menjadi juru masak istana setelah berhasil memukau sang raja dengan masakannya yang memadukan teknik modern dan bahan tradisional.

Di tengah hiruk pikuk politik istana, Ji-yeong harus berhadapan dengan selir ambisius Kang Mok-ju dan Pangeran Je Seon, yang diam-diam berencana merebut takhta. Melalui setiap hidangan yang ia sajikan, Ji-yeong perlahan meluluhkan hati Yi Heon dan membangkitkan kenangan masa kecil yang penuh kehangatan, menantang citra sang raja yang selama ini dikenal dingin dan kejam.

Serial ini memadukan romansa, komedi, dan intrik politik dalam satu kisah. Di tengah perjalanan lintas waktu ini, Ji-yeong harus menemukan cara untuk bertahan hidup, melindungi orang-orang yang ia sayangi, dan memutuskan, apakah ia akan mengubah sejarah atau kembali ke masa kini?