Hamilton mengisahkan perjalanan hidup Alexander Hamilton dalam dua babak besar, menyoroti perjuangannya di tengah Perang Revolusi Amerika saat ia menjadi ajudan kepercayaan George Washington. Cerita ini juga menampilkan sisi personalnya, mulai dari kisah cintanya dengan Eliza Schuyler hingga langkah ambisiusnya membangun karier sebagai pengacara dan Menteri Keuangan.

Namun, di balik kejeniusannya, ada sosok lain yang tak kalah penting, yaitu Aaron Burr, narator utama dalam sebagian besar cerita. Persaingan dan perbedaan pandangan antara keduanya perlahan memanas, hingga akhirnya membawa mereka pada duel yang tragis dan merenggut nyawa Hamilton.

Bagaimana kisah dua tokoh besar ini berubah dari rekan seperjuangan menjadi musuh yang saling menantang di medan duel?