Film aksi-komedi Hitman 2 kembali mengikuti kisah Jun, mantan agen rahasia yang kini beralih profesi menjadi kreator webtoon.

Setelah sempat sukses lewat webtoon populer berjudul Assassination Agent Jun, karier Jun mulai merosot ketika musim kedua komiknya mendapat kritik pedas dari pembaca. Banyak orang menganggap ceritanya terlalu berlebihan hingga membuat Jun dijuluki sebagai "penulis tanpa otak".

Namun keadaan berubah drastis ketika serangkaian serangan teroris di dunia nyata justru memiliki kemiripan mencurigakan dengan plot yang ia tulis di musim kedua. Kesamaan itu membuat badan intelijen Korea, NIS, mulai mencurigai Jun sebagai otak di balik serangan tersebut.

Jun yang sebenarnya tidak bersalah mendadak menjadi buronan sekaligus tersangka utama. Untuk membersihkan namanya, ia harus menghadapi situasi berbahaya yang mengingatkannya kembali pada masa lalunya sebagai agen rahasia sambil mencari tahu siapa dalang sebenarnya yang meniru ide ceritanya untuk melakukan kejahatan nyata.