Mary menghadirkan kisah kelahiran dan perjalanan awal seorang perempuan yang kelak menjadi figur penting dalam sejarah, dengan deretan pemain Noa Cohen, Mila Harris, Ido Tako, Ori Pfeffer, Hilla Vidor, Dudley O'Shaughnessy, Anthony Hopkins, Mili Avital, Stephanie Nur, Gudmundur Thorvaldsson, Salim Benmoussa, dan Mehmet Kurtuluş.

KLovers, film ini dibuka dengan doa panjang Joachim dan Anne yang akhirnya dijawab ketika malaikat Gabriel menampakkan diri dan menjanjikan seorang anak perempuan dengan syarat ia dipersembahkan untuk melayani Tuhan.

Mary pun lahir di Nazareth, sementara di sisi lain Herodes Agung mulai membangun kembali Bait Suci Kedua di tengah kecemasan politik yang berujung pada kekerasan di lingkaran istananya sendiri.

Mary tumbuh dan dipersembahkan ke Bait Suci Yerusalem untuk dididik dalam pengabdian. Di sana ia bertemu tokoh tokoh bijak yang membimbingnya hingga remaja. Pertemuannya dengan Joseph terjadi secara sederhana namun menentukan, karena Joseph segera meminang Mary dengan restu orang tuanya.

Setelah pertunangan, Gabriel kembali hadir dan menyampaikan kabar besar bahwa Mary akan mengandung dan melahirkan seorang putra bernama Yesus. Kabar kehamilan itu justru memicu penolakan keras dari para Imam Besar yang mengusir Mary dari Bait Suci, memaksanya menghadapi bisik bisik dan prasangka masyarakat.

Mary mencari perlindungan dengan mengunjungi sepupunya Elizabeth yang juga sedang mengandung. Namun rumor terus menyebar, hingga Mary hampir dirajam massa saat mencoba menjelaskan keadaannya kepada Joseph.

Di momen genting itu, Joseph berdiri di sisinya, menegaskan cintanya dan kesediaannya menerima Mary beserta anak yang dikandungnya. Keduanya menikah, lalu memilih bersembunyi dan melakukan perjalanan ke Bethlehem demi keselamatan, menutup kisah dengan harapan dan keteguhan iman di tengah tekanan zaman.