Phir Aayi Hasseen Dillruba membawa KLovers kembali ke dunia penuh intrik, cinta gelap, dan pembalasan dendam, dengan deretan pemain utama Taapsee Pannu sebagai Rani, Vikrant Massey sebagai Rishu/Ravi, dan Harshvardhan Rane sebagai Abhimanyu. Film ini melanjutkan kisah dari Haseen Dillruba, menampilkan strategi, pengkhianatan, dan twist yang membuat kita terus menebak-nebak siapa yang sebenarnya bisa dipercaya.

Cerita dimulai lima tahun setelah peristiwa sebelumnya, Rani menjalankan salon kecantikan di Agra, sementara Rishu hidup dengan identitas baru sebagai Ravi dan menggunakan tangan prostetik. Mereka tinggal terpisah untuk menghindari deteksi polisi tapi tetap berkomunikasi lewat telepon, merencanakan kabur ke Thailand. Sementara itu, Abhimanyu, dokter yang menyukai Rani, mulai mendekatinya, namun Rani menolak. Di sisi lain, Poonam, pemilik kos Rishu, juga mencoba mendekati Rishu, yang menolaknya.

A.C.P Kishore Rawat dan Inspektur Senior Manav Shukla muncul di Agra untuk menegaskan bahwa Rani dan Rishu bertanggung jawab atas kematian Neel. Monty Paswan, paman Neel, memimpin penyelidikan dan segera menggagalkan rencana kabur mereka dengan menangkap agen perjalanan Rishu. Panik, Rani memutuskan menikahi Abhimanyu untuk mengalihkan kecurigaan, dengan syarat hubungan mereka tetap platonis. Pernikahan ini diterima Abhimanyu meski awalnya terkejut, dan keduanya menjaga jarak.

Seiring waktu, rahasia mulai terungkap. Malam-malam, Rani secara tidak sengaja memberi tahu Abhimanyu tentang rencana kabur bersama Rishu. Abhimanyu awalnya bersedia membantu, menyembunyikan Rishu di kliniknya. Namun, dia kemudian menunjukkan sisi psikopatnya dengan menyerang Rani dan merencanakan pembunuhan orang-orang yang menjadi saksi, termasuk Poonam dan Lallan. Rani ditahan polisi, dan Rishu diiming-imingi untuk menyerah di jembatan, memunculkan ketegangan klimaks. Di sana, Rani dan Rishu tampak terancam oleh Abhimanyu yang menyamar sebagai polisi, dan ketiganya jatuh ke sungai penuh buaya.

Flashback kemudian mengungkap bahwa Abhimanyu, Rani, dan Rishu sebenarnya bekerja sama untuk menipu polisi. Abhimanyu membunuh saksi kunci dan memalsukan kematiannya. Rishu kehilangan prostetik tangannya saat melawan arus, membuatnya diduga tewas, sementara Rani dan Abhimanyu selamat. Enam bulan kemudian, Rani dan Abhimanyu hidup di Deosar, tapi Rani kemudian mengetahui bahwa Abhimanyu membunuh Rishu. Ia konfrontasi dan melompat dari tebing, namun ternyata Rishu selamat, mereka bersatu kembali, sementara Abhimanyu ditangkap. Twist terakhir mengungkap identitas Abhimanyu sebagai putra Dinesh Pandit.