The Equalizer 3 membuka kisah Robert McCall yang diperankan Denzel Washington, bersama Dakota Fanning sebagai Emma Collins dan Eugenio Mastrandrea sebagai Gio Bonucci, dalam babak paling personal dari perjalanan sang mantan pembunuh bayaran. Cerita dimulai di sebuah kilang anggur terpencil di Sisilia, tempat McCall menuntaskan misi berdarah demi merebut kembali uang hasil kejahatan siber. Namun aksi itu berujung petaka ketika ia ditembak dari belakang oleh cucu Lorenzo Vitale, membuat McCall terluka parah dan berada di ambang keputusasaan.

Dalam kondisi sekarat dan dihantui luka fisik serta batin, McCall sempat mempertimbangkan untuk mengakhiri hidupnya. Ia kemudian membatalkan niat tersebut dan menyeberang ke daratan Italia dengan feri. Di sepanjang pesisir Amalfi, tubuhnya tak lagi kuat menahan syok hingga ia pingsan di pinggir jalan. Nasib baik mempertemukannya dengan Gio Bonucci, seorang carabiniere lokal yang menolongnya dan membawanya ke desa pesisir Altamonte untuk dirawat oleh Dr. Enzo Arisio.

Masa pemulihan di Altamonte menjadi titik balik emosional bagi McCall. Ia mulai mengenal warga desa, merasakan kehangatan komunitas kecil, dan menemukan ketenangan yang selama ini sulit ia raih. Namun ketenangan itu terusik ketika McCall secara anonim menghubungi agen CIA Emma Collins, memberi petunjuk tentang peran rahasia kilang anggur dalam perdagangan narkoba. Penyelidikan CIA membuktikan kecurigaan McCall dengan ditemukannya uang tunai dalam jumlah besar dan tablet fenethylline. Emma pun melacak keberadaan McCall di Altamonte dan keduanya kembali bekerja sama.

Di sisi lain, ancaman nyata datang dari Camorra yang dipimpin bersaudara Vincent dan Marco Quaranta. Mereka meneror warga Altamonte dengan pemerasan dan kekerasan demi menguasai wilayah itu untuk kepentingan komersial. McCall menyaksikan sendiri Marco menekan Angelo, pemilik toko ikan, hingga akhirnya toko tersebut dibakar sebagai peringatan brutal. Kejadian itu mengguncang desa dan memicu penyelidikan Gio ke kepolisian pusat.

Usaha Gio berujung bahaya ketika Camorra menculik istri dan anaknya sebagai umpan. Gio dipukuli karena dianggap mencampuri urusan mereka, sementara Marco menuntut bantuan untuk memperluas jaringan ke Somalia. McCall yang mendengar ancaman tersebut akhirnya turun tangan. Ia meminta Marco memindahkan operasinya dan meninggalkan warga Altamonte. Penolakan Marco menjadi pemicu konfrontasi terakhir, di mana McCall kembali pada sisi gelapnya demi melindungi orang-orang yang telah ia anggap keluarga.