Cerita dibuka dengan adegan misterius: seorang pria tersesat di tengah hutan dan tiba-tiba ditarik ke bawah tanah—kelihatannya sih dia nggak selamat. Dari situ, film langsung kasih sinyal, “Oke, ini bakal jadi kisah yang mencekam.”

Lalu kita kenalan sama Mina, pegawai toko hewan di Galway, Irlandia. Suatu hari, dia diminta nganterin burung beo emas ke kebun binatang dekat Belfast. Awalnya kelihatan kayak kerjaan biasa, tapi di tengah jalan mobilnya mogok di tengah hutan terpencil. Saat nyoba cari bantuan, Mina malah nemuin bunker tua dan seorang nenek bernama Madeline, yang langsung bilang, “Kalau kamu pengen hidup, masuk ke sini sekarang juga.”

Ternyata bunker itu disebut The Coop—semacam tempat perlindungan. Di dalamnya, ada dua orang lain: Ciara dan Daniel, yang juga dulunya tersesat dan akhirnya tinggal bareng Madeline. Saat malam tiba, mereka semua berdiri di depan jendela besar berlapis cermin buat “menyambut” makhluk yang mereka sebut The Watchers.

Madeline menjelaskan ke Mina, para Watcher itu semacam makhluk misterius yang suka meniru manusia. Mereka cuma muncul di malam hari dan bakal membunuh siapa pun yang berada di luar bunker. Siang hari, mereka ngilang ke bawah tanah—ke tempat yang disebut the Burrows—karena mereka benci banget sama cahaya matahari.

Ketiganya udah berbulan-bulan terjebak di sana. Suami Ciara, John, sempat nekat keluar beberapa hari lalu tapi nggak pernah balik. Mina yang penasaran akhirnya ngajak Daniel buat ngintip isi Burrows. Di sana mereka nemuin barang-barang aneh kayak handycam, sepeda, dan sisa-sisa kehidupan manusia lain—tapi mereka juga hampir ketahuan sama Watcher dan cuma bisa kabur dengan napas ngos-ngosan.

Malamnya, tiba-tiba John muncul di luar bunker. Tapi Madeline nggak mau bukain pintu karena yakin itu bukan John beneran, tapi Watcher yang lagi nyamar. Bener aja, para Watcher jadi ngamuk dan mecahin kaca besar The Coop sebagai peringatan. Madeline akhirnya mutusin buat balikin semua barang yang mereka temuin ke Burrow biar para Watcher tenang lagi.

Waktu berlalu, musim dingin datang, dan suasana di The Coop makin panas. Ketegangan di antara mereka bertiga makin parah—bahkan suatu malam Daniel ngunci Madeline dan Mina di luar bunker, bikin mereka harus bertahan hidup di hutan gelap sendirian. Dari situ mereka akhirnya ngelihat wujud asli para Watcher: makhluk humanoid yang bisa meniru gerakan dan suara manusia kayak cermin hidup.

Begitu mereka berhasil balik ke The Coop, Madeline akhirnya buka suara. Ia bilang kalau para Watcher itu sebenarnya peri pengubah bentuk (shapeshifting fairies) yang sedang belajar meniru manusia biar bisa hidup kayak kita. Di tengah serangan para Watcher, mereka nemuin pintu rahasia menuju ruangan bawah tanah tersembunyi. Di sana, Mina nemuin rekaman video dari Profesor Rory Kilmartin, peneliti yang dulu datang ke hutan buat mempelajari para peri itu.

Lewat video diary-nya, profesor bercerita kalau dia pernah nangkep satu peri dan malah jadi dekat dengannya. Tapi lama-lama dia depresi karena sadar hubungannya itu berbahaya. Dalam rekaman terakhirnya, dia ngasih tahu cara keluar dari hutan dan minta agar semua penelitiannya dimusnahkan. Setelah itu, dia bilang bakal “mengakhiri segalanya”—nembak peri yang dia tangkap, lalu dirinya sendiri.

Keesokan harinya, rombongan kecil itu ngikutin petunjuk si profesor menuju sungai di tepi hutan. Di sana, Madeline nunjukin sebuah batu tua yang katanya jadi tempat para peri dikurung dan dipotong sayapnya setelah perang besar lawan manusia. Tapi sebelum mereka bisa kabur, salah satu Watcher yang nyamar jadi John muncul dan membunuh Daniel. Madeline dan Ciara berhasil kabur bareng Mina, naik perahu profesor buat keluar dari hutan.

Setelah sampai di dunia luar, Mina pergi ke universitas tempat Profesor Kilmartin dulu bekerja buat ngancurin semua catatan risetnya. Tapi dari arsip itu, dia justru nemuin fakta mencengangkan: dulu manusia dan peri pernah hidup damai, bahkan beberapa dari mereka menikah dan punya anak campuran. Di situ juga dia sadar kalau wajah Madeline mirip banget sama istri profesor yang udah meninggal tahun 2001. Dari situ Mina ngerti—Madeline ternyata peri itu sendiri.

Saat Mina mampir ke rumah Ciara, mereka tiba-tiba diserang oleh Madeline. Madeline akhirnya ngaku kalau dia diusir dari kelompok Watcher karena dia bisa tahan hidup di bawah sinar matahari—hal yang mustahil buat peri biasa. Mina lalu nyimpulin, mungkin Madeline itu hibrida—setengah manusia, setengah peri. Dia bujuk Madeline buat berhenti benci manusia dan cari jalan hidupnya sendiri bersama para hibrida lain.

Akhirnya, Madeline tumbuh sayap indah dan terbang pergi, meninggalkan Mina dengan perasaan lega tapi juga sedih.

Beberapa waktu kemudian, Mina akhirnya berdamai dengan saudara kembarnya yang dulu renggang hubungannya. Ia bilang kalau Madeline masih “mengawasinya”, dan kini hadir dalam wujud seorang gadis kecil di tengah keramaian—seolah hubungan mereka nggak pernah benar-benar putus.