Hi Nanna membuka cerita hangat tentang keluarga kecil yang penuh luka dan cinta. Film ini dibintangi Nani sebagai Viraj, Mrunal Thakur sebagai Varsha atau Yashna, serta Kiara Khanna sebagai Mahi. Kita diajak mengikuti kehidupan Mahi, gadis enam tahun yang tinggal di Mumbai bersama ayahnya Viraj, sang kakek, dan anjing kesayangan mereka, Pluto. Mahi mengidap cystic fibrosis, dan Viraj yang berprofesi sebagai fotografer fashion sukses memilih menomorsatukan perawatan putrinya di atas segalanya.

Sejak kecil, Mahi tumbuh tanpa kehadiran ibu. Setiap kali ia bertanya, Viraj selalu menghindar. Sikap itu membuat Mahi sedih dan merasa tidak dipercaya. Suatu hari, ia nekat kabur dari rumah bersama Pluto. Insiden berbahaya hampir terjadi sebelum mereka diselamatkan oleh seorang perempuan bernama Yashna. Pertemuan ini menjadi titik balik cerita, karena atas permintaan Mahi, Yashna mengajak Viraj makan bersama dan membujuknya untuk akhirnya menceritakan kisah sang ibu yang ia panggil "Varsha". Demi membantu Mahi membayangkan cerita itu, Yashna pun berpura pura menjadi Varsha.

Viraj mulai bernostalgia ke sepuluh tahun lalu, saat ia bertemu Varsha di Coonoor. Varsha adalah perempuan yang trauma oleh perceraian orang tuanya dan kehilangan kepercayaan pada pernikahan. Perlahan, kehangatan Viraj meluluhkan ketakutannya. Mereka menikah meski ditentang ibu Varsha dan harus menjalani hidup sederhana dengan kondisi finansial pas pasan. Kebahagiaan mereka terasa utuh sampai karier Viraj menanjak dan keinginan memiliki anak muncul. Varsha sempat ragu, namun akhirnya setuju.

Kebahagiaan itu runtuh ketika Mahi lahir dengan penyakit serius. Varsha terpukul, merasa hidupnya hancur, dan mulai menyalahkan Viraj serta menyesali pernikahan mereka. Cerita ini membuat Mahi sedih dan meminta ayahnya berhenti. Namun di balik layar, Yashna yang mendengarkan tampak emosional dan justru meminta Viraj melanjutkan. Ia lalu menceritakan kecelakaan mobil yang terjadi setelah kondisi Varsha memburuk, sebuah kejadian yang membuat semua orang percaya Varsha telah tiada.

Plot twist besar pun terungkap. Yashna sebenarnya adalah Varsha. Ia selamat dari kecelakaan, tetapi mengalami amnesia dan kehilangan seluruh ingatan tentang masa lalunya, termasuk pernikahan dan anaknya. Ibu Varsha kemudian berbohong kepada Viraj, mengklaim putrinya menginginkan perceraian dan memaksanya menjauh demi melindungi kondisi mental Varsha. Dengan hati hancur, Viraj membesarkan Mahi seorang diri. Pertemuan kembali mereka dipicu oleh Pluto yang mengenali Varsha, sementara Viraj sengaja mengubah detail cerita agar ingatan Varsha tidak kembali secara tiba tiba. Situasi semakin kompleks saat terungkap Yashna telah bertunangan dengan Dr. Aravind, dokter saraf yang pernah menanganinya.