Setelah petualangan terakhir mereka, para Muppets masih bingung mau ngapain lagi. Manajer tur baru mereka, Dominic Badguy, mengusulkan tur dunia. Tanpa mereka sadari, Badguy ternyata bekerja diam-diam untuk Constantine, kriminal nomor satu dunia yang wajahnya mirip banget dengan Kermit.

Usai kabur dari penjara gulag di Siberia, Constantine dan Badguy merancang rencana licik, menjadikan tur Muppets sebagai kedok serangkaian pencurian kelas kakap. Di pemberhentian pertama tur di Berlin, Kermit yang lagi stres disergap Constantine.

Sang kriminal menempelkan tahi lalat palsu ke wajah Kermit agar terlihat seperti buronan, lalu membuatnya ditangkap dan dikirim ke gulag Siberia. Constantine pun mengambil alih posisi Kermit, sukses menipu hampir semua Muppets, sementara Badguy mengatur venue mewah yang kebetulan dekat dengan target-target bernilai tinggi.

Cerita lalu berjalan paralel. Di gulag, Kermit gagal terus kabur karena penjaga penjara bernama Nadya, yang justru menunjuknya sebagai penanggung jawab acara pencarian bakat narapidana. Di sana, Kermit mulai akrab dengan para tahanan. Sementara itu, di tur dunia, Constantine dan Badguy memanfaatkan konser sebagai pengalihan untuk mencuri karya seni berharga.

Aksi mereka menarik perhatian agen Interpol Jean Pierre Napoleon dan agen CIA Sam Eagle, yang akhirnya bekerja sama menyelidiki kasus ini. Tur berlanjut ke Madrid dan Dublin, sambil menyiapkan rencana puncak Constantine, mencuri Permata Mahkota Inggris. Namun Walter dan Fozzie Bear mulai curiga. Mereka menemukan fakta bahwa Badguy menyuap para kritikus dan menyadari 'Kermit' yang sekarang bukanlah Kermit asli.

Setelah diserang Constantine, Walter, Fozzie, dan Animal,yang ternyata sudah sadar sejak awal soal penyamaran ini,berhasil kabur. Mereka pun memutuskan terbang ke Siberia demi menyelamatkan Kermit yang asli.